Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms