Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Habp4Q9JKS5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms