Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms