Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx5Q9JKQ4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms