Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx6Q9JKK1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stx6Q9JKK1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms