Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms