Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx3Q9JKB3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms