Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uchl3Q9JKB1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uchl3Q9JKB1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms