Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnga3Q9JJZ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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