Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ddx20Q9JJY4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ddx20Q9JJY4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Ddx20Q9JJY4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ddx20Q9JJY4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ddx20Q9JJY4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ddx20Q9JJY4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ddx20Q9JJY4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ddx20Q9JJY4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Ddx20Q9JJY4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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