Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacng4Q9JJV4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacng4Q9JJV4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms