Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms