Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc6l2Q9JIM3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms