Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms