Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod3Q9JHJ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod3Q9JHJ0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Tmod3Q9JHJ0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Tmod3Q9JHJ0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tmod3Q9JHJ0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tmod3Q9JHJ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tmod3Q9JHJ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tmod3Q9JHJ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tmod3Q9JHJ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Tmod3Q9JHJ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Tmod3Q9JHJ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Tmod3Q9JHJ0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod3Q9JHJ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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