Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DysfQ9ESD7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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DysfQ9ESD7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms