Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp29Q9ES63 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp29Q9ES63 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp29Q9ES63 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Usp29Q9ES63 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp29Q9ES63 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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