Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms