Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MesdQ9ERE7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MesdQ9ERE7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms