Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms