Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clstn2Q9ER65 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms