Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spock2Q9ER58 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spock2Q9ER58 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms