Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnn1Q9EQR3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Kcnn1Q9EQR3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnn1Q9EQR3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms