Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms