Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Ndst3Q9EQH7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Ndst3Q9EQH7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Ndst3Q9EQH7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ndst3Q9EQH7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ndst3Q9EQH7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ndst3Q9EQH7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ndst3Q9EQH7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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