Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r44Q9EQ47 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms