Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pold3Q9EQ28 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pold3Q9EQ28 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms