Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SgshQ9EQ08 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms