Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r172Q9EPS4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r172Q9EPS4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms