Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp1bQ9EPL6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp1bQ9EPL6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms