Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCF9

Ssr3, Translocon-associated protein subunit gamma, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr3Q9DCF9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ssr3Q9DCF9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr3Q9DCF9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr3Q9DCF9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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