Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Xab2Q9DCD2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Xab2Q9DCD2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms