Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hmgn3Q9DCB1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms