Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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