Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc46a3Q9DC26 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms