Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Foxp4Q9DBY0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms