Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms