Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms