Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr53Q9DB94 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms