Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fundc1Q9DB70 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fundc1Q9DB70 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms