Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pop5Q9DB28 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop5Q9DB28 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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