Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem38bQ9DAV9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem38bQ9DAV9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms