Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sgf29Q9DA08 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms