Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700123K08RikQ9D991 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700123K08RikQ9D991 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms