Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs5Q9D920 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs5Q9D920 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs5Q9D920 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs5Q9D920 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs5Q9D920 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs5Q9D920 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs5Q9D920 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs5Q9D920 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs5Q9D920 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs5Q9D920 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms