Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tvp23bQ9D8T4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tvp23bQ9D8T4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms