Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkbh4Q9D8F1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms