Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms