Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnajc4Q9D844 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnajc4Q9D844 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms