Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh2d4aQ9D7V1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms